ส่วนสารบรรณ มีหน้าที่รับผิดชอบดำเนินงานสารบรรณ งานสารบรรณอิเล็กทรอนิกส์ งานเอกสารของกรม ทำหน้าที่ลงทะเบียน ควบคุมทะเบียน รับ-ส่งเอกสารทั้งภายในและภายนอก งานแจกจ่ายเอกสาร งานค้นหาเอกสาร ติดตาม จัดเก็บ ทำลายเอกสาร งานรับ-ส่งไปรษณีย์ โทรสาร ตลอดจนปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

มีหน้าที่รับผิดชอบด้านการบริหารทรัพยากรบุคคล การวางแผนอัตรากำลัง โครงสร้าง ระบบงาน การกำหนดตำแหน่ง การจัดทำและเก็บรักษาทะเบียนประวัติ ฐานข้อมูลทรัพยากรบุคคล การสรรหา บรรจุ แต่งตั้ง โอน ย้าย เลื่อนตำแหน่ง การประเมินผลการปฏิบัติราชการและบำเหน็จความชอบ การเลื่อนเงินเดือน ค่าจ้าง การพัฒนาทรัพยากรบุคคล การส่งเสริมวินัยและระบบคุณธรรม การจัดสวัสดิการในกรมทรัพยากรน้ำ การเกษียณอายุราชการ ตลอดจนปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

มีหน้าที่รับผิดชอบตรวจสอบ กลั่นกรอง สรุปประเด็นสำคัญของเอกสารก่อนที่จะนำเสนอผู้บริหาร รวมทั้งทำหน้าที่เลขานุการอธิบดี รองอธิบดี ร่างหนังสือโต้ตอบและเตรียมการเรื่องการประชุม ดูแลอุปกรณ์การประชุม ติดต่อประสานงาน ตลอดจนปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

มีหน้าที่รับผิดชอบดำเนินงานเกี่ยวกับระบบบริหารการเงินการคลังภาครัฐแบบอิเล็กทรอนิกส์ใหม่ (New Government Fiscal Management Information System Thai : New GFMIS Thai) การจัดการเงิน ควบคุม การรับเงิน การเบิกจ่ายเงินแต่ละประเภท การเก็บรักษาเงิน การนำเงินส่งคลังผ่านระบบอิเล็กทรอนิกส์ (e-Payment) งานสวัสดิการ จัดทำฎีกา งานด้านเงินเดือนและค่าจ้าง รวมถึงบำเหน็จบำนาญ และเงินเพิ่มอื่นๆ ควบคุมตรวจสอบการจัดทำบัญชี จัดทำรายงานทางการเงิน คำนวณต้นทุนผลผลิต บันทึกข้อมูลสินทรัพย์ในระบบสินทรัพย์ถาวร รวมทั้งงานบัญชีรายได้ตามกฎหมายว่าด้วยทรัพยากรน้ำ และทะเบียนตามระเบียบราชการ งานตรวจสอบใบสำคัญและควบคุมการเบิกจ่ายเงิน จัดทำรายงานฐานะการเงิน การควบคุม กำกับ ติดตามการใช้จ่ายงบประมาณ การโอนจัดสรร โอนเปลี่ยนแปลงงบประมาณ และการโอนเงินงบประมาณเบิกจ่ายแทนกันในระบบ New GFMIS Thai การขอกันเงินงบประมาณไว้เบิกเหลื่อมปี และการขยายเวลาเบิกจ่ายเงินงบประมาณ งานกองทุนและสวัสดิการ ตลอดจนปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

มีหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับการจัดซ้อ การจ้าง การจ้างที่ปรึกษา การจ้างออกแบบและควบคุมงาน การแลกเปลี่ยน การเช่า การยืม การควบคุม การจำหน่ายพัสดุ การจัดทำสัญญา ใบสั่งซื้อ ใบสั่งจ้าง การบริหารสัญญา ตรวจสอบจัดทำเอกสารสำคัญประกอบการเบิกจ่ายเงิน การบันทึกรายการใบสั่งซื้อ Purchase Order:PO ในระบบ GF-MIS การจัดทำทะเบียนบัญชีควบคุมพัสดุ การจัดทำรายงานผลดำเนินการจัดซื้อจัดจ้าง การตรวจสอบพัสดุประจำปี การซ่อมบำรุงรักษาพัสดุ การให้คำปรึกษา ข้อเสนอการปฏิบัติเกี่ยวกับการพัสดุ ตลอดจนปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

ควบคุมการรักษาความปลอดภัย จัดระเบียบการใช้อาคารสถานที่ให้เป็นไปตามกฎหมาย ระเบียบ ข้อบังคับของทางราชการ การควบคุมดูแลการใช้รถยนต์ ซ่อมแซม บำรุงรักษาการใช้รถยนต์ของทางราชการและน้ำมันเชื้อเพลิงให้เป็นไปตามกฎหมาย ระเบียบ ข้อบังคับของทางราชการ การคว่บคุมพนักงานขับรถยนต์ ตลอดจนปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

ดำเนินงานผลิตข่าว บทความ สารคดีเพื่อเผยแพร่ทางสื่อภายนอก อาทิ โทรทัศน์ วิทยุ หนังสือพิมพ์ เว็บไซต์ การจัดนิทรรศการและดำเนินงานผลิตข่าว บทความสารคดีเพื่อเผยแพร่ทางสื่อภายใน อาทิ โปสเตอร์ เสียงตามสาย และดำเนินงานด้านการถ่ายภาพนิ่ง ภาพเคลื่อนไหว และจัดทำสารคดี รวมถึงการดำเนินงานเกี่ยวกับศูนย์ข้อมูลข่าวสารของกรมทรัพยากรน้ำ อาทิ การรับโทรศัพท์ การรับเรื่องราวร้องทุกข์ การจัดประชุม ติดตาม ตรวจสอบ และชี้แจงข่าวที่บิดเบือนจากข้อเท็จจริง ส่งเสริม และสนับสนุนการดำเนินงานของโฆษกกรม จัดทำข่าวสาร หรือจัดเตรียมการแถลงข่าวของผู้บริหารประสานงานกับสื่อมวลชน เครือข่ายสื่อมวลชน เครือข่ายประชาสัมพันธ์ ทั้งนี้รวมถึงงานธุรการและเอกสารต่างๆด้วย

1) เสริมสร้างวินัยและพัฒนางานวินัย ให้ความรู้คำปรึกษา และข้อเสนอแนะเกี่ยวกับการดำเนินการทางวินัยแก่เจ้าหน้าที่ รวมทั้งเสนอข้อกำหนดแนวปฏิบัติต่างๆ เกี่ยวกับการดำเนินการทางวินัย
2) ดำเนินการตรวจสอบ พิจารณาพยานหลักฐาน และเสนอความเห็นเบื้องต้นของข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการที่เกี่ยวข้องกับการดำเนินการทางวินัยและตามกฎหมายที่เกี่ยวข้อง
3) ตรวจสอบพิจารณาและเสนอความเห็นกรณีร้องเรียน กล่าวหาหรือสงสัยว่าข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการกระทำความผิดวินัย
4) ดำเนินการเกี่ยวกับการแต่งตั้งคณะกรรมการสืบสวนข้อเท็จจริง การตรวจสอบรายงานการสืบสวนข้อเท็จจริงของข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการ
5) ดำเนินการเกี่ยวกับการแต่งตั้งคณะกรรมการสอบสวนทางวินัยอย่างร้ายแรง และคณะกรรมการสอบสวนทางวินัยอย่างไม่ร้ายแรง การตรวจสอบรายงานการสอบสวนวินัยของข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการ กลั่นกรองเสนอความเห็นเกี่ยวกับรายงานสอบสวนและรายงานการดำเนินการทางวินัยเพื่อพิจารณาแนวทางการลงโทษเสนอต่ออธิบดีกรมทรัพยากรน้ำ ปลัดกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม อ.ก.พ.กรมทรัพยากรน้ำ และ อ.ก.พ.กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม
6) เสนอความเห็นเกี่ยวกับการลงโทษและอุทธรณ์ทางวินัยของข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการ
7) ดำเนินการเกี่ยวกับการร้องทุกข์ของข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการ
8) ตรวจสอบข้อมูลการดำเนินการทางวินัยของข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการ
9) ดำเนินการทางวินัย ในส่วนที่เกี่ยวข้องกับข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และพนักงานราชการ อันสืบเนื่องมาจากการถูกดำเนินคดีปกครอง คดีทุจริตและประพฤติมิชอบ และคดีอาญา
10) ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย